Fusarium moniliforme appartient à la section Liseola, qui est caractérisée par une absence de chlamydospores, et par une production de microconidies en chainettes, sur des conidiophores à monophialide. Cette espèce développe un thalle blanc qui, après quelques jours de croissance à 25° C, prend parfois une teinte violette à lie de vin. La coloration rose saumon, observée dans certaines cultures, indique la présence de sporodochies à lnacroconidies. On observe fréquemment une production de microsclérotes de coloration bleue-noire. La forme sexuée de F. moniliforme est un Ascomycète : Gibberella fujikuroï.