L’inoculum, sous forme de spores, survit dans le sol en l’absence d’hôtes. L’inoculum transmis par les semences se multiplie et s’installe dans le sol après la plantation et c’est à partir de là que l’agent pathogène infecte la plante. Dès qu’elle atteint un stade sensible les feuilles s’infectent par le contact avec le sol ou par la pluie. L'inoculum est transféré aux feuilles inférieures. De là l'agent pathogène se propage lentement à d'autres feuilles. Des températures de 20 à 25 ° C sont optimales pour le développement de la maladie. Les spores germent à la surface des feuilles produisant jusqu'à 4 tubes germinaux. Après la pénétration, les hyphes se développent à travers le tissu de la feuille, de manière intra et extra-cellulaire. Alternaria triticina produit des toxines non spécifiques à l’hôte qui contribuent à la mort et à l’effondrement des cellules, et au développement des lésions.